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salmon quasi-mapping 原理解析
时间 2021-01-03
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quasi-mapping是基于k-mers+Suffix Array。 salmon原文链接 什么是Suffix Array请点这里 quasi-mapping是由RapMap这篇文章提出来的 第一步:建立索引 如果有多个transcript,那将多个transcripts连起来用$分割。使用rank9b algorithm and data structure of Vigna 使得任意位置的
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