NUMA的取舍与优化设置

  在os层numa关闭时,打开bios层的numa会影响性能,QPS会降低15-30%;html

  在bios层面numa关闭时,不管os层面的numa是否打开,都不会影响性能。 node

      安装numactl:  
      #yum install numactl -y
      #numastat      等同于 cat /sys/devices/system/node/node0/numastat ,/sys/devices/system/node/文件夹中记录系统中的全部内存节点的相关详细信息。        #numactl --hardware  列举系统上的NUMA节点
mysql

      #numactl  --show   查看绑定信息linux

 

 

 

      Redhat或者Centos系统中能够经过命令判断bios层是否开启numa
      # grep -i numa /var/log/dmesg
      若是输出结果为: No NUMA configuration found 
      说明numa为disable,若是不是上面内容说明numa为enable,例如显示:NUMA: Using 30 for the hash shift.
      能够经过lscpu命令查看机器的NUMA拓扑结构。ios

当发现numa_miss数值比较高时,说明须要对分配策略进行调整。例如将指定进程关联绑定到指定的CPU上,从而提升内存命中率。算法


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     如今的机器上都是有多个CPU和多个内存块的。之前咱们都是将内存块当作是一大块内存,全部CPU到这个共享内存的访问消息是同样的。这就是以前广泛使用的SMP模型。可是随着处理器的增长,共享内存可能会致使内存访问冲突愈来愈厉害,且若是内存访问达到瓶颈的时候,性能就不能随之增长。NUMA(Non-Uniform Memory Access)就是这样的环境下引入的一个模型。好比一台机器是有2个处理器,有4个内存块。咱们将1个处理器和两个内存块合起来,称为一个NUMA node,这样这个机器就会有两个NUMA node。在物理分布上,NUMA node的处理器和内存块的物理距离更小,所以访问也更快。好比这台机器会分左右两个处理器(cpu1, cpu2),在每一个处理器两边放两个内存块(memory1.1, memory1.2, memory2.1,memory2.2),这样NUMA node1的cpu1访问memory1.1和memory1.2就比访问memory2.1和memory2.2更快。因此使用NUMA的模式若是能尽可能保证本node内的CPU只访问本node内的内存块,那这样的效率就是最高的。mongodb

在运行程序的时候使用numactl -m和-physcpubind就能制定将这个程序运行在哪一个cpu和哪一个memory中。玩转cpu-topology 给了一个表格,当程序只使用一个node资源和使用多个node资源的比较表(差很少是38s与28s的差距)。因此限定程序在numa node中运行是有实际意义的。数据库

可是呢,话又说回来了,制定numa就必定好吗?--numa的陷阱。SWAP的罪与罚文章就说到了一个numa的陷阱的问题。现象是当你的服务器还有内存的时候,发现它已经在开始使用swap了,甚至已经致使机器出现停滞的现象。这个就有多是因为numa的限制,若是一个进程限制它只能使用本身的numa节点的内存,那么当自身numa node内存使用光以后,就不会去使用其余numa node的内存了,会开始使用swap,甚至更糟的状况,机器没有设置swap的时候,可能会直接死机!因此你可使用numactl --interleave=all来取消numa node的限制。缓存

 

综上所述得出的结论就是,根据具体业务决定NUMA的使用。

若是你的程序是会占用大规模内存的,你大多应该选择关闭numa node的限制(或从硬件关闭numa)。由于这个时候你的程序颇有概率会碰到numa陷阱。

另外,若是你的程序并不占用大内存,而是要求更快的程序运行时间。你大多应该选择限制只访问本numa node的方法来进行处理。

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内核参数overcommit_memory :

它是 内存分配策略

可选值:0、一、2。

0:表示内核将检查是否有足够的可用内存供应用进程使用;若是有足够的可用内存,内存申请容许;不然,内存申请失败,并把错误返回给应用进程。

1:表示内核容许分配全部的物理内存,而无论当前的内存状态如何。

2:表示内核容许分配超过全部物理内存和交换空间总和的内存

内核参数zone_reclaim_mode:

可选值0、1

a、当某个节点可用内存不足时:

一、若是为0的话,那么系统会倾向于从其余节点分配内存

二、若是为1的话,那么系统会倾向于从本地节点回收Cache内存多数时候

b、Cache对性能很重要,因此0是一个更好的选择

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mongodb的NUMA问题

mongodb日志显示以下:

WARNING: You are running on a NUMA machine.

We suggest launching mongod like this to avoid performance problems:

numactl –interleave=all mongod [other options]

解决方案,临时修改numa内存分配策略为 interleave=all (在全部node节点进行交织分配的策略):

1.在原启动命令前面加numactl –interleave=all

如# numactl --interleave=all ${MONGODB_HOME}/bin/mongod --config conf/mongodb.conf

2.修改内核参数

echo 0 > /proc/sys/vm/zone_reclaim_mode ; echo "vm.zone_reclaim_mode = 0" >> /etc/sysctl.conf

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1、NUMA和SMP

NUMA和SMP是两种CPU相关的硬件架构。在SMP架构里面,全部的CPU争用一个总线来访问全部内存,优势是资源共享,而缺点是总线争用激烈。随着PC服务器上的CPU数量变多(不只仅是CPU核数),总线争用的弊端慢慢愈来愈明显,因而Intel在Nehalem CPU上推出了NUMA架构,而AMD也推出了基于相同架构的Opteron CPU。

NUMA最大的特色是引入了node和distance的概念。对于CPU和内存这两种最宝贵的硬件资源,NUMA用近乎严格的方式划分了所属的资源组(node),而每一个资源组内的CPU和内存是几乎相等。资源组的数量取决于物理CPU的个数(现有的PC server大多数有两个物理CPU,每一个CPU有4个核);distance这个概念是用来定义各个node之间调用资源的开销,为资源调度优化算法提供数据支持。

2、NUMA相关的策略

一、每一个进程(或线程)都会从父进程继承NUMA策略,并分配有一个优先node。若是NUMA策略容许的话,进程能够调用其余node上的资源。

二、NUMA的CPU分配策略有cpunodebind、physcpubind。cpunodebind规定进程运行在某几个node之上,而physcpubind能够更加精细地规定运行在哪些核上。

三、NUMA的内存分配策略有localalloc、preferred、membind、interleave。

localalloc规定进程从当前node上请求分配内存;

而preferred比较宽松地指定了一个推荐的node来获取内存,若是被推荐的node上没有足够内存,进程能够尝试别的node。

membind能够指定若干个node,进程只能从这些指定的node上请求分配内存。

interleave规定进程从指定的若干个node上以RR(Round Robin 轮询调度)算法交织地请求分配内存。

 

 

由于NUMA默认的内存分配策略是优先在进程所在CPU的本地内存中分配,会致使CPU节点之间内存分配不均衡,当某个CPU节点的内存不足时,会致使swap产生,而不是从远程节点分配内存。这就是所谓的swap insanity 现象。

MySQL采用了线程模式,对于NUMA特性的支持并很差,若是单机只运行一个MySQL实例,咱们能够选择关闭NUMA,关闭的方法有三种:

1.硬件层,在BIOS中设置关闭

2.OS内核,启动时设置numa=off;

3.能够用numactl命令将内存分配策略修改成interleave(交叉)。

若是单机运行多个MySQL实例,咱们能够将MySQL绑定在不一样的CPU节点上,而且采用绑定的内存分配策略,强制在本节点内分配内存,这样既能够充分利用硬件的NUMA特性,又避免了单实例MySQL对多核CPU利用率不高的问题

3、NUMA和swap的关系

可能你们已经发现了,NUMA的内存分配策略对于进程(或线程)之间来讲,并非公平的。在现有的Redhat Linux中,localalloc是默认的NUMA内存分配策略,这个配置选项致使资源独占程序很容易将某个node的内存用尽。而当某个node的内存耗尽时,Linux又恰好将这个node分配给了某个须要消耗大量内存的进程(或线程),swap就妥妥地产生了。尽管此时还有不少page cache能够释放,甚至还有不少的free内存。

4、解决swap问题

虽然NUMA的原理相对复杂,实际上解决swap却很简单:只要在启动MySQL以前使用numactl –interleave来修改NUMA策略便可。

值得注意的是,numactl这个命令不只仅能够调整NUMA策略,也能够用来查看当前各个node的资源使用状况,是一个很值得研究的命令。

 

 

1、CPU  首先从CPU提及。  你仔细检查的话,有些服务器上会有的一个有趣的现象:你cat /proc/cpuinfo时,会发现CPU的频率居然跟它标称的频率不同:  #cat /proc/cpuinfo  processor : 5  model name : Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2620 0 @2.00GHz  cpu MHz : 1200.000  这个是Intel E5-2620的CPU,他是2.00G * 24的CPU,可是,咱们发现第5颗CPU的频率为1.2G。  这是什么缘由呢?  这些其实都源于CPU最新的技术:节能模式。操做系统和CPU硬件配合,系统不繁忙的时候,为了节约电能和下降温度,它会将CPU降频。这对环保人士和抵制地球变暖来讲是一个福音,可是对MySQL来讲,多是一个灾难。  为了保证MySQL可以充分利用CPU的资源,建议设置CPU为最大性能模式。这个设置能够在BIOS和操做系统中设置,固然,在BIOS中设置该选项更好,更完全。因为各类BIOS类型的区别,设置为CPU为最大性能模式千差万别,咱们这里就不具体展现怎么设置了。  而后咱们看看内存方面,咱们有哪些能够优化的。  i) 咱们先看看numa  非一致存储访问结构 (NUMA : Non-Uniform Memory Access) 也是最新的内存管理技术。它和对称多处理器结构 (SMP : Symmetric Multi-Processor) 是对应的。简单的队别以下:  如图所示,详细的NUMA信息咱们这里不介绍了。可是咱们能够直观的看到:SMP访问内存的都是代价都是同样的;可是在NUMA架构下,本地内存的访问和非 本地内存的访问代价是不同的。对应的根据这个特性,操做系统上,咱们能够设置进程的内存分配方式。目前支持的方式包括:  --interleave=nodes  --membind=nodes  --cpunodebind=nodes  --physcpubind=cpus  --localalloc  --preferred=node  简而言之,就是说,你能够指定内存在本地分配,在某几个CPU节点分配或者轮询分配。除非 是设置为--interleave=nodes轮询分配方式,即内存能够在任意NUMA节点上分配这种方式之外。其余的方式就算其余NUMA节点上还有内 存剩余,Linux也不会把剩余的内存分配给这个进程,而是采用SWAP的方式来得到内存。有经验的系统管理员或者DBA都知道SWAP致使的数据库性能 降低有多么坑爹。  因此最简单的方法,仍是关闭掉这个特性。  关闭特性的方法,分别有:能够从BIOS,操做系统,启动进程时临时关闭这个特性。  a) 因为各类BIOS类型的区别,如何关闭NUMA千差万别,咱们这里就不具体展现怎么设置了。  b) 在操做系统中关闭,能够直接在/etc/grub.conf的kernel行最后添加numa=off,以下所示:  kernel /vmlinuz-2.6.32-220.el6.x86_64 ro root=/dev/mapper/VolGroup-root rd_NO_LUKS LANG=en_US.UTF-8 rd_LVM_LV=VolGroup/root rd_NO_MD quiet SYSFONT=latarcyrheb-sun16 rhgb crashkernel=auto rd_LVM_LV=VolGroup/swap rhgb crashkernel=auto quiet KEYBOARDTYPE=pc KEYTABLE=us rd_NO_DM  numa=off  另外能够设置 vm.zone_reclaim_mode=0尽可能回收内存。  c) 启动MySQL的时候,关闭NUMA特性:  numactl --interleave=all mysqld  固然,最好的方式是在BIOS中关闭。  ii) 咱们再看看vm.swappiness。  vm.swappiness是操做系统控制物理内存交换出去的策略。它容许的值是一个百分比的值,最小为0,最大运行100,该值默认为60。vm.swappiness设置为0表示尽可能少swap,100表示尽可能将inactive的内存页交换出去。  具体的说:当内存基本用满的时候,系统会根据这个参数来判断是把内存中不多用到的inactive 内存交换出去,仍是释放数据的cache。cache中缓存着从磁盘读出来的数据,根据程序的局部性原理,这些数据有可能在接下来又要被读 取;inactive 内存顾名思义,就是那些被应用程序映射着,可是 长时间 不用的内存。  咱们能够利用vmstat看到inactive的内存的数量:  #vmstat -an 1  procs -----------memory---------- ---swap-- -----io---- --system-- -----cpu-----  r b swpd free inact active si so bi bo in cs us sy id wa st  1 0 0 27522384 326928 1704644 0 0 0 153 11 10 0 0 100 0 0  0 0 0 27523300 326936 1704164 0 0 0 74 784 590 0 0 100 0 0  0 0 0 27523656 326936 1704692 0 0 8 8 439 1686 0 0 100 0 0  0 0 0 27524300 326916 1703412 0 0 4 52 198 262 0 0 100 0 0  经过/proc/meminfo 你能够看到更详细的信息:  #cat /proc/meminfo | grep -i inact  Inactive: 326972 kB  Inactive(anon): 248 kB  Inactive(file): 326724 kB  这里咱们对不活跃inactive内存进一步深刻讨论。 Linux中,内存可能处于三种状态:free,active和inactive。众所周知,Linux Kernel在内部维护了不少LRU列表用来管理内存,好比LRU_INACTIVE_ANON, LRU_ACTIVE_ANON, LRU_INACTIVE_FILE , LRU_ACTIVE_FILE, LRU_UNEVICTABLE。其中LRU_INACTIVE_ANON, LRU_ACTIVE_ANON用来管理匿名页,LRU_INACTIVE_FILE , LRU_ACTIVE_FILE用来管理page caches页缓存。系统内核会根据内存页的访问状况,不定时的将活跃active内存被移到inactive列表中,这些inactive的内存能够被 交换到swap中去。  通常来讲,MySQL,特别是InnoDB管理内存缓存,它占用的内存比较多,不常常访问的内存也会很多,这些内存若是被Linux错误的交换出去了,将浪费不少CPU和IO资源。 InnoDB本身管理缓存,cache的文件数据来讲占用了内存,对InnoDB几乎没有任何好处。  因此,咱们在MySQL的服务器上最好设置vm.swappiness=1或0

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