简单易用的序列处理工具SeqHandler介绍

简单易用的序列处理工具SeqHandler-v1.0.0介绍

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在实际工做工程中常常须要处理一些序列,须要的功能可能也是极其简单的,好比:查看长度、ATCG各个碱基的含量、GC含量等等。个人作法是把那个须要拷贝到ipython(一个Python的解释工具),而后再各类操做,操做到了发现这些东西都是重复性的,并且是很简单的,因而就萌生了作一个简单的序列处理工具的想法。工具

如今SeqHandler的功能有限,仅有:长度、ATCG含量统计、GC含量统计、反向互补、截取子序列功能,你们对功能提一些建议。spa

使用的方法也是很简单地:图片

  1. 第一步,打开序列文件(目前支持fa、fq、gb),支持一个文件里面含有多条序列
    图片描述
  2. 选中序列
    图片描述
  3. 各类操做
    ![图片描述][3]
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