haploview绘制曼哈顿图

时间 2021-01-22

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欢迎关注"生信修炼手册"！对于GWAS分析的结果，最常见的可视化手段就是曼哈顿图了。一个典型的曼哈顿图示例如下图中的每个点代表一个SNP位点，横坐标是SNP位点在染色体上的位置，纵坐标是关联分析计算出的p值。为了美观，不同染色体上的SNP位点用不同颜色标识。纵轴上的虚线代表阈值，p值越小，对应到纵轴的值越大。通常在阈值上方的SNP位点认为是和疾病或者形状相关联的位点。曼哈顿图本质上就是一个散

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