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宏基因组拼接方法
时间 2021-01-06
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de novo定义:from the beginning(从头拼接), no reference genome guided(无参考基因组) 三类de novo基因拼接的计算方法: 1. Greedy algorithm:对于含重复区的序列拼接效果不好 Shortest common string (SCS):最短的、包含原序列S中所有的k-mer的序列 但是Greedy algorithm为追求
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