DICOM,是医学图像和相关信息的国际标准。
常见类型有MR和CT,而它们在处理上有细微的不一样。html
MATLAB内置dicom库,直接调用便可。web
% filename 就是你要用的DICOM文件的名字 % 不要使用其余奇怪的东西 filename = 'CT.dcm'; dcm = dicomread(filename); info = dicominfo(filename);
参数名 | 描述 | 其余 | |
---|---|---|---|
1 | Height | 行数 | |
2 | Width | 列数 | |
3 | PixelSpacing | 像素间隔(单位:mm) | |
4 | SliceLocation | 切片位置(单位:mm) | |
5 | SpacingBetweenSlices | 层间距(单位:mm) | |
6 | RescaleIntercept | 缩放截距 | 仅CT |
7 | RescaleSlope | 缩放斜率 | 仅CT |
8 | WindowCenter | 窗位 | |
9 | WindowWidth | 窗宽 |
查看方式以下:svg
info.WindowCenter info.WindowWidth info.RescaleSlope info.RescaleIntercept info.PixelSpacing info.SliceLocation
具体使用方式在后面介绍。函数
CT值是测定人体某一局部组织或器官密度大小的一种计量单位,一般称亨氏单位(hounsfield unit ,HU)。如空气为-1000,致密骨为+1000。
而磁共振图像的信号绝对值,不像CT有明确的物理意义。磁共振更关心不一样组织之间信号的强弱对比关系。(感兴趣可自行查阅磁共振图像成像步骤)spa
%% 读取数据 filename = 'MR.dcm'; dcm = dicomread(filename); info = dicominfo(filename); dcm = double(dcm); % 转为double方便后续处理 %% 归一化处理(此处也可直接使用mat2gray()函数) lv = min(dcm(:)); uv = max(dcm(:)); dcmIM = (dcm - lv)/(uv - lv); %% 显示 figure subplot(121), imagesc(dcm) colorbar, title('原始数据') subplot(122), imagesc(dcmIM) colorbar, title('图像数据') colormap gray;
2. CT
CT成像信号会转换为灰度保存在DICOM文件中,因此在使用前要先转回CT值,再根据窗位窗宽进行归一化处理。.net
%% 读取数据 filename = 'MR.dcm'; dcm = dicomread(filename); dcm = double(dcm); % 转为double方便后续处理 %% 灰度转CT值 dcmCT = dcm * info.RescaleSlope + info.RescaleIntercept; %% 调窗+归一化 k = 1; % 一般有1至2个窗,但我不知道你的数据有多神奇 lv = info.WindowCenter - info.WindowWidth(k)/2; uv = info.WindowCenter + info.WindowWidth(k)/2; dcmIM = (dcmCT-lv)/info.WindowWidth(k); dcmIM(dcmIM<0) = 0; dcmIM(dcmIM>1) = 1; %% 显示 figure subplot(131),imagesc(dcm) colorbar,title('原始数据') subplot(132),imagesc(dcmCT) colorbar,title('CT数据') subplot(133),imagesc(dcmIM) colorbar,title('图像数据') colormap gray;
有任何问题欢迎讨论,最后仍是把演示代码上传
https://download.csdn.net/download/xsz591541060/11221516
因为很简单,不推荐下载,除非你买了年VIP。3d