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MACS -- Model-based Analtsis of ChiP-Seq 原理
时间 2021-01-12
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MACS基本原理 TF在基因组上的结合其实是一个随机过程,基因组的每个位置其实都有机会结合某个TF,只是概率不一样,说白了,peak出现的位置,是TF结合的热点,而peak-calling就是为了找到这些热点。 如何定义热点呢?通俗地讲,热点是这样一些位置,这些位置多次被测得的read所覆盖(我们测的是一个细胞群体,read出现次数多,说明该位置被TF结合的几率大)。那么,read
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