bwa比对软件的使用以及其结果文件(sam)格式说明

1、bwa比对软件的使用html 一、对参考基因组构建索引 算法 bwa index -a bwtsw hg19.fa   #  -a 参数:is[默认] or bwtsw,即bwa构建索引的两种算法,两种算法都是基于BWT的(BWT search while the CIGAR string by Smith-Waterman alignment.)。-a bwtsw对于短的参考序列是不工做的,
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