Milvus 百万向量搜索实验(附数据,测试脚本,性能数据)

一、准备测试数据和脚本

本实验所使用的原始数据集为 SIFT1B ,关于该数据集的详细信息请参考:http://corpus-texmex.irisa.fr/。在本次测试中,咱们提取了原始数据集中的 100 万条数据。python

经实测,如下硬件配置可顺利完成实验:git

Component Minimum Config
OS Ubuntu LTS 18.04
CPU Intel Core i5-8250U
GPU Nvidia GeForce MX150, 2GB GDDR5
GPU Driver CUDA 10.1, Driver 418.74
Memory 8 GB DDR4
Storage NVMe SSD 256 GB

测试工具下载:sql

为方便存放测试数据和脚本,请建立名为 milvus_sift1m 的文件夹。利用前文提供的下载连接,将测试数据集下载到 milvus_sift1m 目录下:docker

  • 测试数据集下载并解压完成以后,你将会看到一个名为 bvecs_data 的文件夹。该文件夹里面存放了 10 个 npy 文件,每一个 npy 文件中存放了10 万条 uint8 格式的向量数据。
  • 查询向量集下载完成以后,你会看到一个 query.npy 的文件,该文件里存放了 10,000 条实验中须要查询的向量。
  • 对照数据( groundtruth )包含一个名为 ground_truth.txt 的文本文件,该文件里存放的是查询向量集中的每条向量的 top1000 类似向量的位置。
  • 测试脚本会包含一个 python 程序 milvus_bootcamp.py 和一个 shell 脚本 get_id.sh。

获取完测试须要的数据和脚本后, milvus_sift1m 目录下应该存放有如下内容:shell

  1. 100 万测试数据: bvecs_data 文件夹
  2. 10,000 条查询向量集: query.npy
  3. 10,000 条查询向量集的 ground truth:ground_truth.txt
  4. 测试脚本:milvus_bootcamp.py 和 get_id.sh

注意bash

使用脚本 milvus_bootcamp.py 进行测试以前,请仔细阅读该脚本的 README 。并根据实际状况,对脚本中的相关变量值进行修改。 使用脚本 get_id.sh 测试以前须要为它添加可执行权限,执行下述指令:工具

$ chmod +x get_id.sh

二、 配置 Milvus 参数

Milvus 能够根据数据分布和性能、准确性的要求灵活调整相关系统参数,以发挥产品的最佳性能。在此实验中,采用以下表所示的参数配置,就能够实现90%以上召回率。性能

配置文件: /home/$USER/milvus/conf/server_config.yaml测试

参数名称 推荐值
index_building_threshold 64
cpu_cache_capacity 4
use_blas_threshold 801
nprobe 32

其他参数保持默认便可。配置文件参数修改完毕后,重启 Milvus Docker 使配置生效。ui

$ docker restart <container id>

三、 数据导入

导入数据以前,首先确保 bvecs_data 文件夹与测试脚本 milvus_bootcamp.py 都放在 milvus_sift1m 目录下,而后确认 Milvus 已经正常启动。( Milvus 安装及启动方法参见:Milvus 快速上手

进入 milvus_sift1m 目录,运行以下脚本:

$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 --index=ivfsq8 -t

脚本会建立一张名为 ann_1m_sq8 的表,它采用的索引类型为 ivfsq8 ,并导入数据:

1m_import

上述过程完成以后,运行以下脚本以查看 Milvus 中存在的的表,以及表中的向量条数:

$ python3 milvus_bootcamp.py --show
$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 --rows

数据导入完成后,会在 milvus_sift1m 目录下产生一个名为 ann_1m_sq8_idmap.txt 的文件,该文件中存放的是 Milvus 为每一条向量分配的向量编号( ids )以及该向量的具体位置。

为了确保导入 Milvus 的数据已经所有建好索引,请进入 /home/$USER/milvus/db 目录,在终端输入以下命令:

$ sqlite3 meta.sqlite

进入交互式命令行以后,输入以下命令,检查向量数据表当前的状态:

sqlite> select * from TableFiles where table_id='ann_1m_sq8';
30|ann_1m_sq8|3|1565599487052367000|3|102400000|1565599495009366|1565599487052372|1190712
31|ann_1m_sq8|3|1565599495107862000|3|102400000|1565599502559292|1565599495107863|1190712
32|ann_1m_sq8|3|1565599502656466000|3|102400000|1565599510079453|1565599502656467|1190712
33|ann_1m_sq8|3|1565599510129972000|3|51200000|1565599513555987|1565599510129973|1190712
34|ann_1m_sq8|3|1565599513650120000|3|102400000|1565599521067974|1565599513650121|1190712
35|ann_1m_sq8|3|1565599521132604000|3|51200000|1565599524843984|1565599521132605|1190712

Milvus 会将一个向量数据表分红若干数据分片进行存储,所以查询命令会返回多条记录。其中第三列数字表明数据表采用的索引类型,数字 3 表明采用的是 ivfsq8 索引。第五列数字表明索引构建的状况,当这列数字为 3 时,表明相应的数据表分片上的索引已构建完毕。若是某个分片上的索引尚未构建完成,能够手动为这个数据分片创建索引。进入 milvus_sift1m 目录,运行以下脚本:

$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 --build

手动创建索引后,再次进入 sqlite 交互界面,确认全部数据分片都已经建好索引。若是想了解其余列数据表明的含义,请进入 /home/$USER/milvus/db 目录,在 sqlite 交互界面输入以下命令进行查看。

sqlite>.schema

四、准确性测试

SIFT1B 提供了10,000 条向量的查询向量集,而且对于每条查询向量都给出了该向量在不一样规模数据集上的 top1000 ground truth。所以,能够方便地对 Milvus 查询结果的准确率进行计算。准确率计算公式为:

准确率= ( Milvus 查询结果与 Groundtruth 一致的向量个数 ) / ( query_records 的向量个数 * top_k )

(1)执行准确性测试脚本

从 10,000 条查询向量中随机取出 10 条向量,而后测试 Milvus 针对这 10 条向量的 top20 结果的准确率。进入 milvus_sift1m 目录,运行以下脚本:

$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 -q 10 -k 20 -s

(2)验证准确性测试结果

上述脚本运行完成后,将会生成一个名为 accuracy_results 的文件夹,在该文件夹下面会有一个名为 10_20_result.csv 的文件,文件里的内容以下图所示:

1m_accu_10_20

  • nq: 表明的是第几个查询向量
  • topk: 表明的是查询该向量的前 k 个类似的向量
  • total_time: 表明整个查询花费的总时间,单位:秒
  • avg_time: 表明每一条向量的平均查询时间,单位:秒
  • recall: 表明 milvus 的查询结果与 ground truth 对比后的准确率

Milvus 查询准确率与搜索子空间( nprobe 参数)有很大关系。本次测试中 nprobe 设置为32,Milvus 查询准确率能够达到 90% 以上。能够经过增大 nprobe 值来实现更高的准确率但同时也会下降 Milvus 的查询性能。

所以,须要结合实际数据分布和业务SLA,调整搜索子空间大小以达到性能和准确性的平衡。

五、性能测试

为评估 Milvus 的查询性能,进入 milvus_sift1m 目录,运行以下脚本:

$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 -s

运行结束后,将会生成一个名为 performance_results 的文件夹,在该文件夹下会有一个名为 xxx_results.csv 的文件,'xxx' 表明执行命令的时间。文件内容以下图所示(未彻底展现):

1m_per_10_20

  • nq: 表明要查询的向量数
  • topk: 表明的是查询某个向量的前 k 个类似的向量
  • total_time: 表明的是查询 nq个向量的前 k 个类似向量一共花费的时间,单位:秒
  • avg_time: 表明的是查询一个向量的 topk 个类似向量的平均时间,单位:秒

注意

  1. milvus_bootcamp.py 中设置的待测试的 nq 为:一、50、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800。对于每个 nq,milvus_bootcamp.py 设置的 topk 为:一、20、50、100、300、500、800、1000。
  2. Milvus 启动后,进行第一次向量检索时,须要花部分时间加载数据到内存。
  3. 若是两次测试间隔一段时间,Intel CPU可能降频至基础频率。性能测试时尽可能连续运行测试案例。第一个测试案例能够运行两次,取第二次的运行时间。
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