一文搞懂TCGA中的分析结果如何来

欢迎关注”生信修炼手册”! TCGA对于不同类型的数据，有着独特的处理流程，具体如下 1. DNA-Seq Analysis Pipeline TCGA中的DNA测序主要用来分析肿瘤患者中的体细胞突变，和GATK的体细胞突变流程类似，前期都经过了一个预处理步骤，这里称之为co-cleanning, 流程示意如下 就是经典的sort->markduplicate->Realign->BQSR步骤，得

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