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上一篇是数据挖掘的前戏,主要目的是认识数据特征、判断特征重要性、观察数据异常,掌握数据间联系。本篇将继续上一篇分析进行数据挖掘建模部分。app
上篇数据分析的连接:
【Kaggle入门级竞赛top5%排名经验分享】— 分析篇dom
数据预处理涉及的内容不少,也包括特征工程,是任务量最大的一部分。为了让你们更清晰的阅读,如下先列出处理部分大体要用到的一些方法。学习
one-hot
和 label coding
;分析部分咱们看到,存在缺失值的特征有4个:Age,Cabin,Embarked,Fare。关于缺失值处理部分博主以前介绍过一些方法:【Python数据分析基础】: 数据缺失值处理测试
下面开始对缺失值分别处理。优化
Fare缺失值处理编码
首先查看一下Fare特征缺失:spa
df[df['Fare'].isnull()]
发现只有一个缺失值,其实能够直接删除,可是好多乘客都是以一个家庭来的,这其中会有很强的联系,并会给咱们很好的线索,所以选择不删除。
继续观察一下这个缺失值乘客有什么特色?如何利用咱们以前的分析来处理?
这时咱们可使用类似特征替换方法来填补缺失值,下面来找一下与缺失值具备类似特征的其它样本数据:
df.loc[(df['Pclass']==3)&(df['Age']>60)&(df['Sex']=='male')]
找到了与之相匹配的几位其它乘客,咱们就用这几位乘客的Fare平均值来填补。
# 提取出Name中的Surname信息 df['surname'] = df["Name"].apply(lambda x: x.split(',')[0].lower()) fare_mean_estimated = df.loc[(df['Pclass']==3)&(df['Age']>60)&(df['Sex']=='male')].Fare.mean() df.loc[df['surname']=='storey','Fare'] = fare_mean_estimated
Embarked特征缺失值
一样,观察Embarked
的缺失值状况:
# Embarked缺失值处理 df[df['Embarked'].isnull()]
发现两位都是女性
。上篇可视化分析过,pclass1
且为女性的状况下,Q港口
几乎为0,而C港口
最多,其次S港口
,下图为分析篇的可视化结果。
这里采用出现最多的港口,也就是众数C港口进行填补。
df['Embarked'] = df['Embarked'].fillna('C')
Cabin特征缺失值
Cain特征有70%
的缺失值,较为严重,若是进行大量的填补会引入更多噪声。由于缺失值也是一种值,这里将Cabin缺失值视为一种特殊的值来处理,并根据Cabin首个字符衍生一个新的特征CabinCat
。
df['CabinCat'] = pd.Categorical.from_array(df.Cabin.fillna('0').apply(lambda x: x[0])).codes
pandas的 Categorical.from_array()
用法。代码含义是用“0”
替换Cabin缺失值
,并将非缺失Cabin特征值提取出第一个值以进行分类,好比A114就是A,C345就是C,以下:
[0, C, 0, C, 0, ..., 0, C, 0, 0, 0] Length: 1309 Categories (9, object): [0, A, B, C, ..., E, F, G, T]
用Categorical.from_array()
将Cabin分红了9组,最后经过codes量化为数字,经过可视化观察一下分组离散化后的结果:
fig, ax = plt.subplots(figsize=(10,5)) sns.countplot(x='CabinCat', hue='Survived',data=df) plt.show()
以上可视化看到:Cabin缺失的乘客中,遇难人数是获救人数2倍以上,而其它有Cabin信息的乘客中,获救人数都相对较多。所以说明Cabin缺失与否关系到了生还的几率。
Age特征缺失值
Age有20%缺失值,缺失值较多,大量删除会减小样本信息,因为它与Cabin不一样,这里将利用其它特征进行预测填补Age,也就是拟合未知Age特征值,会在后续进行处理。
数据一致性分析
当咱们拿到数据后,咱们要谨记一个道理:不要彻底相信数据。即便不是异常值,也有多是错误的信息,那就是检查数据的一致性。
本例中,咱们经过两个错误的修正来理解一下。
错误1:SibSp和Parch特征存在不一致
df.loc[df['surname']=='abbott',['Name','Sex','Age','SibSp','Parch']]
为了方便阅读,下面用序号来代替名字。
首先寻找到了船上姓 abbott
的全部人,即一家人。发现:392 乘客只有13岁,确有两个孩子Parch=2
(理论上不太可能),而279乘客35岁,有一个孩子,还有一个兄弟姐妹,746有一个家长和一个兄弟姐妹。很明显,信息是错误的,279与392乘客的信息写反了。正确的信息是一位母亲带着两个孩子,因此改成:279乘客为SibSp=0,Parh=2
,392岁的乘客是:SibSp=1, Parh=1
。下面是修改代码:
df.loc[(df['surname']=='abbott')&(df['Age']==35),'SibSp'] = 0 df.loc[(df['surname']=='abbott')&(df['Age']==35),'Parch'] = 2 df.loc[(df['surname']=='abbott')&(df['Age']==13),'SibSp'] = 1 df.loc[(df['surname']=='abbott')&(df['Age']==13),'Parch'] = 1
错误2:SibSp和Parch特征存在不一致
df.loc[df['surname']=='ford',['Name','Sex','Age','SibSp','Parch']]
同理,ford
一家人也出现了一致性错误的问题,具体你们可自行分析。正确的是:一位母亲带着三个孩子,而最后一位乘客为测试集里的样本,推测极可能是父亲。下面是修改代码:
df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==16),'SibSp'] = 3 df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==16),'Parch'] = 1 df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==9),'SibSp'] = 3 df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==9),'Parch'] = 1 df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==21),'SibSp'] = 3 df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==21),'Parch'] = 1 df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==48),'SibSp'] = 0 df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==48),'Parch'] = 4 df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==18),'SibSp'] = 3 df.loc[(df['surname']=='ford')&(df['Age']==18),'Parch'] = 1
衍生变量
分析部分没说起到Name
特征,由于每一个人的名字都不同。可是一些人多是群体行动,好比一家人一块儿,而一家人的surname
是同样的,所以这时候就能够经过surname找到一个家庭群体。家庭群体有什么用?咱们后面会提到。
实际上,若是咱们深刻分析,Name特征是很是重要的。试想一下乘客有没有多是和其余人一块儿上船的?是一家人?情侣?仍是独自一人?而这一群人生还的几率应该是存在共性的,好比:有一个5人之家,有4人死亡,能够推测第5我的极有可能死亡。
下面是对全部特征进行衍生的新特征变量。
# 从Name中提取Title信息,由于同为男性,Mr.和 Master.的生还率是不同的 df["Title"] = df["Name"].apply(lambda x: re.search(' ([A-Za-z]+)\.',x).group(1)) title_mapping = {"Mr": 1, "Miss": 2, "Mrs": 3, "Master": 4, "Dr": 5, "Rev": 6, "Major": 7, "Col": 7, "Mlle": 2, "Mme": 3,"Don": 9,"Dona": 9, "Lady": 10, "Countess": 10, "Jonkheer": 10, "Sir": 9, "Capt": 7, "Ms": 2} # 量化Title信息 df["TitleCat"] = df.loc[:,'Title'].map(title_mapping) # SibSp和Parch特征进行组合 df["FamilySize"] = df["SibSp"] + df["Parch"] + 1 # 根据FamilySize分布进行分箱 df["FamilySize"] = pd.cut(df["FamilySize"], bins=[0,1,4,20], labels=[0,1,2]) # 从Name特征衍生出Name的长度 df["NameLength"] = df["Name"].apply(lambda x: len(x)) # 量化Embarked特征 df["Embarked"] = pd.Categorical.from_array(df.Embarked).codes # 对Sex特征进行独热编码分组 df = pd.concat([df,pd.get_dummies(df['Sex'])],axis=1)
下面衍生特征变量的说明:
高级衍生变量
【1】人物衍生特征
因为儿童的生还率较高,所以将全部乘客儿童单独提取出来(这里设置为18岁)。而对于成年人女性生还几率比较高,因此又非为成年女性和成年男性。代码以下:
# 妇女/儿童 男士标签 child_age = 18 def get_person(passenger): age, sex = passenger if (age < child_age): return 'child' elif (sex == 'female'): return 'female_adult' else: return 'male_adult' df = pd.concat([df, pd.DataFrame(df[['Age', 'Sex']].apply(get_person, axis=1), columns=['person'])],axis=1) df = pd.concat([df,pd.get_dummies(df['person'])],axis=1)
【2】Ticket衍生特征
下面基于Ticket
衍生出了几个高级特征变量,其含义:若是几我的拥有相同的Ticket号码,那么意味着他门是一个小群体(一家人或情侣等),而又由于男性女性还几率本省存在差别,所以将分别衍生出几我的物标签特征,即分群体状况下的男女生还特征。如下是代码实现:
table_ticket = pd.DataFrame(df["Ticket"].value_counts()) table_ticket.rename(columns={'Ticket':'Ticket_Numbers'}, inplace=True) table_ticket['Ticket_dead_women'] = df.Ticket[(df.female_adult == 1.0) & (df.Survived == 0.0) & ((df.Parch > 0) | (df.SibSp > 0))].value_counts() table_ticket['Ticket_dead_women'] = table_ticket['Ticket_dead_women'].fillna(0) table_ticket['Ticket_dead_women'][table_ticket['Ticket_dead_women'] > 0] = 1.0 table_ticket['Ticket_surviving_men'] = df.Ticket[(df.male_adult == 1.0) & (df.Survived == 1.0) & ((df.Parch > 0) | (df.SibSp > 0))].value_counts() table_ticket['Ticket_surviving_men'] = table_ticket['Ticket_surviving_men'].fillna(0) table_ticket['Ticket_surviving_men'][table_ticket['Ticket_surviving_men'] > 0] = 1.0 # Ticket特征量化 table_ticket["Ticket_Id"] = pd.Categorical.from_array(table_ticket.index).codes table_ticket["Ticket_Id"][table_ticket["Ticket_Numbers"] < 3 ] = -1 # Ticket数量分箱 table_ticket["Ticket_Numbers"] = pd.cut(table_ticket["Ticket_Numbers"], bins=[0,1,4,20], labels=[0,1,2]) df = pd.merge(df, table_ticket, left_on="Ticket",right_index=True, how='left', sort=False)
同理,基于衍生变量Surname
也能够衍生出高级特征变量,以及Cabin的奇偶性衍生特征
。
Age缺失值处理
前面说了将采用拟合的方法来填补Age
缺失值,那为何必定要在后面处理呢?
缘由以下:
由于上面已经将所提问题解决,所以能够开始拟合Age缺失值
。这部分使用了随机森林的ExtraTreesRegressor
模型进行拟合,代码以下:
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier, ExtraTreesRegressor classers = ['Fare','Parch','Pclass','SibSp','TitleCat', 'CabinCat','female','male', 'Embarked', 'FamilySize', 'NameLength','Ticket_Numbers','Ticket_Id'] etr = ExtraTreesRegressor(n_estimators=200,random_state=0) X_train = df[classers][df['Age'].notnull()] Y_train = df['Age'][df['Age'].notnull()] X_test = df[classers][df['Age'].isnull()] etr.fit(X_train.as_matrix(),np.ravel(Y_train)) age_preds = etr.predict(X_test.as_matrix()) df['Age'][df['Age'].isnull()] = age_preds
想继续看一下拟合的结果是怎么样,能够经过可视化来观察:
# Age缺失值填补后的状况 X_test['Age'] = pd.Series(age_preds) f,ax=plt.subplots(figsize=(10,5)) sns.swarmplot(x='Pclass',y='Age',data=X_test) plt.show()
观察:经过拟合获得的Age缺失值的可视化展现,整体上看效果还能够,具体须要进一步排查。
过滤法—方差分析
这里特征采用 ANOVA
方差分析的 F值
来对各个特征变量打分,打分的意义是:各个特征变量对目标变量的影响权重。代码以下,使用了sklearn的feature_selection
:
from sklearn.feature_selection import SelectKBest, f_classif,chi2 target = data_train["Survived"].values features= ['female','male','Age','male_adult','female_adult', 'child','TitleCat', 'Pclass','Ticket_Id','NameLength','CabinType','CabinCat', 'SibSp', 'Parch', 'Fare','Embarked','Surname_Numbers','Ticket_Numbers','FamilySize', 'Ticket_dead_women','Ticket_surviving_men', 'Surname_dead_women','Surname_surviving_men'] train = df[0:891].copy() test = df[891:].copy() selector = SelectKBest(f_classif, k=len(features)) selector.fit(train[features], target) scores = -np.log10(selector.pvalues_) indices = np.argsort(scores)[::-1] print("Features importance :") for f in range(len(scores)): print("%0.2f %s" % (scores[indices[f]],features[indices[f]]))
此部分将以前训练和测试合并的数据集分开,由于最后咱们要对测试集进行预测。特征选择权重结果以下(能够经过可视化的方法展现出来):
这里分数越高表明特征权重越大,固然咱们能够规定相应的阈值来选择权重大的特征。
特征相关性分析
除了对特征权重选择外,咱们也要分析特征相关性来筛选特征。相关性大的特征容易形成过拟合现象,所以须要进行剔除。最好的状况就是:全部特征相关性很低,各自的方差或者说信息量很高。
使用了seaborn的heatmap展现相关性,代码以下:
features_selected = features # data_corr df_corr = df[features_selected].copy() colormap = plt.cm.RdBu plt.figure(figsize=(20,20)) sns.heatmap(df_corr.corr(),linewidths=0.1,vmax=1.0, square=True, cmap=colormap, linecolor='white', annot=True) plt.show()
这是个明显的监督分类问题,所以可选择的模型算法不少,或者模型融合等来提升准确度。这里采用了集成学习的随机森林RandomForest
模型。代码以下:
from sklearn import cross_validation rfc = RandomForestClassifier(n_estimators=3000, min_samples_split=4, class_weight={0:0.745,1:0.255}) # rfc = AdaBoostClassifier(n_estimators=3000, learning_rate=0.1, random_state=1) # 交叉验证,建模随机森林 kf = cross_validation.KFold(train.shape[0], n_folds=3, random_state=1) scores = cross_validation.cross_val_score(rfc, train[features_selected], target, cv=kf) print("Accuracy: %0.3f (+/- %0.2f) [%s]" % (scores.mean()*100, scores.std()*100, 'RFC Cross Validation')) rfc.fit(train[features_selected], target) score = rfc.score(train[features_selected], target) print("Accuracy: %0.3f [%s]" % (score*100, 'RFC full test')) importances = rfc.feature_importances_ indices = np.argsort(importances)[::-1] for f in range(len(features_selected)): print("%d. feature %d (%f) %s" % (f + 1, indices[f]+1, importances[indices[f]]*100, features_selected[indices[f]]))
为防止过拟合,采用了K折交叉验证
进行采样。集成学习等高级模型有自带的特征打分方法,训练数据后,咱们能够经过feature_importances
获得特征权重分数(当特征特别多时,也能够做为初始的特征筛选方法)。固然这也能够经过可视化的方法展现出来。
输入结果以下:
# 预测目标值 rfc.fit(train[features_selected], target) predictions = rfc.predict(test[features_selected])
# 输出文件 PassengerId =np.array(test["PassengerId"]).astype(int) my_prediction = pd.DataFrame(predictions, PassengerId, columns = ["Survived"]) my_prediction.to_csv("my_prediction.csv", index_label = ["PassengerId"])
最后,将预测结果输出到excel表中。若是你到Kaggle
将输出的数据提交,你应该获得的分数是:0.8188,也就是说你的准确率是0.8188。这个分数能够达到500/11000
的排名(top5%)。
本篇分析了数据预处理以及建模的部分,完成了最后的生还者预测,有几下几点还须要提升的地方:
以上就是本次项目的所有内容,后续会继续分享新数据分析挖掘项目,敬请期待。
参考: https://www.kaggle.com/franck...
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