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查看感兴趣的snp是否被测到
时间 2021-01-11
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针对现在已有的rs号,想查看这些点在全外数据中是否被测到。因为目前只是有rs号,所以首先需要得到这些rs号所在的位置,然后去bam文件查看是否测到。 1,拿到rs号去进行annovar注释,得到rsid.hg19_multianno.txt。 /media/gsadmin/vd2/tmp/software/annovar/convert2annovar.pl -format rsid rsid.t
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